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Este canal, ASIC1a, fue solo el primer miembro de una pequeña asics hombre familia de canales H -gated. Gracias al trabajo reciente en muchos laboratorios, ahora tenemos una imagen más clara de la función fisiológica de estos canales con H y hay claros indicios de que los ASIC contribuyen al resultado de varios estados fisiopatológicos. ASIC1a había sido clonado por su homología con la amilorida. -sensible canal de Na epitelial (ENaC), con el que comparte aproximadamente el 25% de identidad de secuencia de aminoácidos [3]. Otros homólogos de ASIC incluyen canales activados por péptidos de pólipos [4] y moluscos [5] y canales mech-anosensibles (las degenerinas o canales "DEG") de C. elegans [6].
Además, los ASIC han sido clonados de un vertebrado sin mandíbula (lamprea) [8], de peces cartilaginosos (tiburón) [8], de peces óseos (pez sapo y pez cebra) [9, 10], de pollo [8] y de diferentes mamíferos ( ratón, rata, humano) (Figura 1). Árbol filogenético que ilustra la relación de ASIC seleccionados. Tenga en cuenta que un zapatillas padel asics ortólogo ASIC1 claro está presente en todos los linajes de vertebrados, mientras que ASIC3 hasta ahora solo se ha identificado en especies de mamíferos. El urocordato Ciona contiene un solo gen asico [7], mientras que en los mamíferos el número de genes asicos ha aumentado a cuatro.
Las secuencias de aminoácidos de ASIC seleccionados se alinearon asics padel y el árbol para el cladograma se estableció mediante la unión de vecinos usando ClustalX (software DNAstar); las secuencias en los extremos N y C se habían eliminado. La forma relacionada rata del canal de Na cerebro-hígado-intestino (BLINaC) [156] se incluyó para la comparación. B) Árbol filogenético del filo cordado. Se muestran los principales clados cordados. El color corresponde al color de los ASIC de los organismos de estos clados en (A). Hasta el momento, no se han reportado ASIC de cefalocordados y anfibios; su existencia en estos clados es, sin embargo, probable.
Los cuatro aminoácidos (DFTC) en el terminal C citoplasmático que se unen al dominio PDZ de PICK1 asics noosa [69, 70] también se magnifican en un recuadro. Un ECD grande no es específico para ASIC, pero es compartido por todos los canales DEG / ENaC , aunque su tamaño puede variar. La homología entre diferentes ASIC es mayor en los segundos dos tercios del ECD, mientras que algunas partes del primer tercio se caracterizan por una considerable divergencia de secuencia. Todos los ASIC tienen 14 cisteínas conservadas en su ECD (Figura 2A), lo que probablemente estabiliza la estructura de la ECD mediante la formación de enlaces disulfuro [41]. Como casi todas las proteínas de membrana, los ASIC llevan al menos un N-glucano en el ECD.
Es probable que tengan una función similar en los ASIC. La función del terminal C citoplasmático para los ASIC está menos establecida. En realidad, el término C puede ser bastante corto (> 40 aminoácidos) en algunos ASIC. Aunque el ASIC C-terminus no es indispensable para la actividad del canal (ver más abajo), puede ser bastante importante para la regulación fisiológica de la función ASIC. Por ejemplo, ASIC1a interactúa con su extremo C-terminal (Figura 2B) con el dominio PDZ de la proteína que interactúa con la quinasa C (PICK1) [70, 71]. No se han demostrado directamente interacciones para ASIC1b, pero dado que el término C de ASIC1b es idéntico al de ASIC1a, al menos en principio, este subtipo también puede interactuar con PICK1.
Además zapatillas running asics de las interacciones proteína-proteína mediadas por el extremo C-terminal de ASIC1a, en las neuronas del ganglio de la raíz dorsal, ASIC1a interactúa físicamente con su extremo N-terminal con la cadena ligera de anexina p11, aumentando la expresión de superficie de ASIC1a [72]. Antes de la era del cristal, teníamos una imagen de ASIC compuestos de probablemente cuatro subunidades, cada una con una topología simple general con dos dominios transmembrana, terminales citoplasmáticos cortos y un ECD grande. Aunque estaba claro que el ECD tiene una estructura definida y probablemente compleja, el aspecto exacto de esta estructura era completamente difícil de alcanzar.
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